FlyAtlas 2 – Gene
For a particular Drosophila gene, find the pattern of expression in different tissues.
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Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Transcript ID (e.g. FBtr0079036)
Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Transcript ID (e.g. FBtr0079036)
Gene:
Symbol
shot
shot
Name
short stop
short stop
Annotation Symbol
CG18076
CG18076
| Adult Male | Adult Female | Male v. Female | Larval | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tissue | FPKM | Enrichment | FPKM | Enrichment | M/F | p value | FPKM | Enrichment |
| Head | 41 ± 2.6 | 0.8 | 41 ± 10 | 2.0 | 1.01 | n.s. | ||
| Eye | 38 ± 9.9 | 0.8 | 27 ± 0.4 | 1.3 | 1.41 | n.s. | ||
| Brain / CNS | 19 ± 0.5 | 0.4 | 17 ± 2.3 | 0.9 | 1.10 | n.s. | 16 ± 2.3 | 1.7 |
| Thoracicoabdominal ganglion | 33 ± 4.4 | 0.7 | 30 ± 2.3 | 1.5 | 1.10 | n.s. | ||
| Crop | 58 ± 5.3 | 1.2 | 47 ± 12 | 2.3 | 1.25 | n.s. | ||
| Midgut | 48 ± 2.8 | 0.9 | 17 ± 4.5 | 0.9 | 2.7 | p < 0.01 | 23 ± 2.7 | 2.5 |
| Hindgut | 30 ± 3.4 | 0.6 | 31 ± 5.0 | 1.5 | 0.97 | n.s. | 15 ± 5.2 | 1.7 |
| Malpighian Tubules | 21 ± 10 | 0.4 | 21 ± 11 | 1.1 | 0.97 | n.s. | 11 ± 1.3 | 1.2 |
| Rectal pad | 28 ± 2.0 | 0.5 | 28 ± 0.7 | 1.4 | 0.99 | n.s. | ||
| Salivary gland | 49 ± 1.0 | 1.0 | 29 ± 1.1 | 1.4 | 1.70 | n.s. | 18 ± 6.4 | 1.9 |
| Fat body | 29 ± 5.0 | 0.6 | 29 ± 0.9 | 1.4 | 0.98 | n.s. | 15 ± 3.0 | 1.6 |
| Heart | 34 ± 7.5 | 0.7 | 36 ± 6.6 | 1.8 | 0.96 | n.s. | ||
| Trachea | 70 ± 9.1 | 7.7 | ||||||
| Ovary | 7.8 ± 0.6 | 0.4 | ||||||
| Virgin Spermatheca | 58 ± 14 | 2.9 | ||||||
| Mated Spermatheca | 69 ± 2.8 | 3.4 | ||||||
| Testis | 14 ± 4.6 | 0.3 | ||||||
| Accessory glands | 15 ± 2.7 | 0.3 | ||||||
| Carcass | 26 ± 7.8 | 0.5 | 28 ± 6.7 | 1.4 | 0.95 | n.s. | 15 ± 1.7 | 1.7 |
| Garland cells | 42 ± 7.8 | 4.6 | ||||||
| Whole body | 50 ± 3.3 | 20 ± 0.8 | 2.5 | p < 0.01 | 9.1 ± 0.7 | |||
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| Transcript | Male | Female | Larval | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Name | ID | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Rp | Sg | Fb | Ht | Ts | Ag | Cs | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Rp | Sg | Fb | Ht | Ov | Vs | Ms | Cs | Ns | Mg | Hg | Tu | Sg | Fb | Tr | Cs | Ga |
| RA | FBtr0087619 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RAA | FBtr0304850 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RAB | FBtr0304851 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RAC | FBtr0304852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RAD | FBtr0304853 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RB | FBtr0087616 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RC | FBtr0087620 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RE | FBtr0087618 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RG | FBtr0087617 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RH | FBtr0087621 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RI | FBtr0273222 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RJ | FBtr0273223 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RK | FBtr0273224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RL | FBtr0273225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RM | FBtr0273226 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RN | FBtr0301591 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RO | FBtr0301592 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RP | FBtr0301593 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RQ | FBtr0301964 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RX | FBtr0304847 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RY | FBtr0304848 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RZ | FBtr0304849 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
*Tissue Comparability:
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.