FlyAtlas 2 – Gene
For a particular Drosophila gene, find the pattern of expression in different tissues.
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Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Transcript ID (e.g. FBtr0079036)
Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Transcript ID (e.g. FBtr0079036)
Gene:
Symbol
Pkn
Pkn
Name
Protein kinase N
Protein kinase N
Annotation Symbol
CG2049
CG2049
| Adult Male | Adult Female | Male v. Female | Larval | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tissue | FPKM | Enrichment | FPKM | Enrichment | M/F | p value | FPKM | Enrichment |
| Head | 45 ± 3.3 | 2.2 | 43 ± 1.6 | 2.6 | 1.07 | n.s. | ||
| Eye | 168 ± 43 | 8.2 | 110 ± 8.0 | 6.9 | 1.52 | n.s. | ||
| Brain / CNS | 20 ± 0.8 | 1.0 | 20 ± 2.0 | 1.3 | 0.99 | n.s. | 12 ± 0.5 | 1.2 |
| Thoracicoabdominal ganglion | 29 ± 1.9 | 1.4 | 30 ± 0.2 | 1.9 | 0.95 | n.s. | ||
| Crop | 20 ± 4.0 | 1.0 | 17 ± 3.3 | 1.1 | 1.19 | n.s. | ||
| Midgut | 27 ± 3.9 | 1.3 | 15 ± 1.4 | 0.9 | 1.86 | p < 0.05 | 12 ± 1.6 | 1.2 |
| Hindgut | 11 ± 1.2 | 0.6 | 13 ± 1.1 | 0.8 | 0.85 | n.s. | 8.5 ± 1.5 | 0.8 |
| Malpighian Tubules | 26 ± 1.9 | 1.3 | 26 ± 1.8 | 1.6 | 0.99 | n.s. | 16 ± 3.1 | 1.6 |
| Rectal pad | 9.0 ± 0.8 | 0.4 | 9.1 ± 0.1 | 0.6 | 0.99 | n.s. | ||
| Salivary gland | 42 ± 0.9 | 2.1 | 33 ± 3.7 | 2.0 | 1.30 | n.s. | 13 ± 1.2 | 1.2 |
| Fat body | 16 ± 1.3 | 0.8 | 27 ± 4.1 | 1.7 | 0.57 | p < 0.05 | 12 ± 1.5 | 1.2 |
| Heart | 18 ± 1.0 | 0.9 | 26 ± 4.5 | 1.6 | 0.69 | n.s. | ||
| Trachea | 13 ± 1.6 | 1.2 | ||||||
| Ovary | 13 ± 0.4 | 0.8 | ||||||
| Virgin Spermatheca | 20 ± 2.9 | 1.2 | ||||||
| Mated Spermatheca | 25 ± 3.0 | 1.6 | ||||||
| Testis | 9.1 ± 0.4 | 0.4 | ||||||
| Accessory glands | 13 ± 1.1 | 0.6 | ||||||
| Carcass | 18 ± 1.8 | 0.9 | 24 ± 4.5 | 1.5 | 0.76 | n.s. | 16 ± 1.6 | 1.6 |
| Garland cells | 14 ± 1.8 | 1.4 | ||||||
| Whole body | 20 ± 0.5 | 16 ± 1.8 | 1.27 | p < 0.05 | 10 ± 0.5 | |||
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| Transcript | Male | Female | Larval | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Name | ID | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Rp | Sg | Fb | Ht | Ts | Ag | Cs | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Rp | Sg | Fb | Ht | Ov | Vs | Ms | Cs | Ns | Mg | Hg | Tu | Sg | Fb | Tr | Cs | Ga |
| RB | FBtr0088601 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RC | FBtr0088602 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RD | FBtr0088604 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RE | FBtr0088605 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RF | FBtr0088603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RG | FBtr0112897 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RH | FBtr0301511 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RJ | FBtr0302603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RK | FBtr0302604 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RL | FBtr0306585 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RM | FBtr0308206 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RN | FBtr0339290 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RO | FBtr0339291 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RP | FBtr0339292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RQ | FBtr0339293 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RR | FBtr0339294 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
*Tissue Comparability:
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.