FlyAtlas 2 – Gene
For a particular Drosophila gene, find the pattern of expression in different tissues.
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Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Transcript ID (e.g. FBtr0079036)
Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Transcript ID (e.g. FBtr0079036)
Gene:
Symbol
Rtnl1
Rtnl1
Name
Reticulon-like1
Reticulon-like1
Annotation Symbol
CG33113
CG33113
| Adult Male | Adult Female | Male v. Female | Larval | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tissue | FPKM | Enrichment | FPKM | Enrichment | M/F | p value | FPKM | Enrichment |
| Head | 128 ± 11 | 1.6 | 131 ± 18 | 2.0 | 0.98 | n.s. | ||
| Eye | 220 ± 12 | 2.7 | 190 ± 9.3 | 3.0 | 1.16 | n.s. | ||
| Brain / CNS | 130 ± 6.9 | 1.6 | 122 ± 18 | 1.9 | 1.07 | n.s. | 63 ± 9.5 | 0.4 |
| Thoracicoabdominal ganglion | 163 ± 11 | 2.0 | 172 ± 0.8 | 2.7 | 0.95 | n.s. | ||
| Crop | 177 ± 14 | 2.2 | 212 ± 22 | 3.3 | 0.84 | n.s. | ||
| Midgut | 109 ± 6.6 | 1.3 | 107 ± 25 | 1.7 | 1.01 | n.s. | 104 ± 25 | 0.6 |
| Hindgut | 117 ± 4.3 | 1.4 | 120 ± 4.7 | 1.9 | 0.98 | n.s. | 196 ± 39 | 1.1 |
| Malpighian Tubules | 162 ± 32 | 2.0 | 165 ± 14 | 2.6 | 0.98 | n.s. | 136 ± 11 | 0.8 |
| Rectal pad | 193 ± 10 | 2.4 | 223 ± 0.1 | 3.5 | 0.87 | n.s. | ||
| Salivary gland | 95 ± 5.9 | 1.2 | 81 ± 2.5 | 1.3 | 1.17 | n.s. | 341 ± 26 | 2.0 |
| Fat body | 39 ± 4.5 | 0.5 | 44 ± 13 | 0.7 | 0.90 | n.s. | 761 ± 104 | 4.4 |
| Heart | 80 ± 6.4 | 1.0 | 72 ± 31 | 1.1 | 1.11 | n.s. | ||
| Trachea | 141 ± 14 | 0.8 | ||||||
| Ovary | 58 ± 4.6 | 0.9 | ||||||
| Virgin Spermatheca | 64 ± 11 | 1.0 | ||||||
| Mated Spermatheca | 75 ± 14 | 1.2 | ||||||
| Testis | 58 ± 4.9 | 0.7 | ||||||
| Accessory glands | 60 ± 10 | 0.7 | ||||||
| Carcass | 114 ± 11 | 1.4 | 86 ± 8.8 | 1.3 | 1.32 | p < 0.05 | 304 ± 47 | 1.7 |
| Garland cells | 94 ± 36 | 0.5 | ||||||
| Whole body | 81 ± 6.7 | 64 ± 13 | 1.27 | n.s. | 174 ± 53 | |||
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| Transcript | Male | Female | Larval | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Name | ID | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Rp | Sg | Fb | Ht | Ts | Ag | Cs | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Rp | Sg | Fb | Ht | Ov | Vs | Ms | Cs | Ns | Mg | Hg | Tu | Sg | Fb | Tr | Cs | Ga |
| RA | FBtr0079042 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RB | FBtr0079039 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RC | FBtr0079043 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RD | FBtr0079041 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RE | FBtr0079040 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RF | FBtr0079038 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RG | FBtr0079044 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RH | FBtr0301538 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RI | FBtr0301539 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RJ | FBtr0301540 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RL | FBtr0332413 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
*Tissue Comparability:
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.