FlyAtlas 2 – Gene
For a particular Drosophila gene, find the pattern of expression in different tissues.
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Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Gene:
| Adult Male | Adult Female | Male v. Female | Larval | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tissue | FPKM | Enrichment | FPKM | Enrichment | M/F | p value | FPKM | Enrichment |
| Head | 17 ± 0.7 | 1.7 | 18 ± 3.6 | 1.0 | 0.95 | n.s. | ||
| Eye | 20 ± 0.9 | 2.0 | 17 ± 1.0 | 1.0 | 1.19 | n.s. | ||
| Brain / CNS | 32 ± 1.8 | 3.1 | 29 ± 5.1 | 1.7 | 1.08 | n.s. | 24 ± 1.1 | 3.7 |
| Thoracicoabdominal ganglion | 19 ± 0.9 | 1.9 | 21 ± 1.6 | 1.2 | 0.91 | n.s. | ||
| Crop | 10 ± 1.9 | 1.0 | 8.4 ± 1.8 | 0.5 | 1.23 | n.s. | ||
| Midgut | 12 ± 0.6 | 1.2 | 7.0 ± 0.5 | 0.4 | 1.68 | p < 0.01 | 6.6 ± 0.5 | 1.0 |
| Hindgut | 8.7 ± 0.3 | 0.9 | 9.3 ± 0.7 | 0.5 | 0.93 | n.s. | 4.8 ± 0.7 | 0.7 |
| Malpighian Tubules | 8.5 ± 1.3 | 0.8 | 9.4 ± 1.9 | 0.5 | 0.90 | n.s. | 4.6 ± 0.5 | 0.7 |
| Fat body | 5.3 ± 0.9 | 0.5 | 7.7 ± 0.7 | 0.4 | 0.68 | p < 0.05 | 8.2 ± 0.6 | 1.3 |
| Salivary gland | 16 ± 0.1 | 1.6 | 16 ± 2.3 | 0.9 | 1.00 | n.s. | 17 ± 0.5 | 2.6 |
| Heart | 9.0 ± 1.0 | 0.9 | 18 ± 9.9 | 1.0 | 0.50 | n.s. | ||
| Trachea | 10 ± 0.7 | 1.6 | ||||||
| Ovary | 22 ± 0.8 | 1.2 | ||||||
| Virgin Spermatheca | 12 ± 0.6 | 0.7 | ||||||
| Mated Spermatheca | 13 ± 2.3 | 0.7 | ||||||
| Testis | 11 ± 0.4 | 1.1 | ||||||
| Accessory glands | 14 ± 1.0 | 1.4 | ||||||
| Carcass | 9.5 ± 0.6 | 0.9 | 13 ± 1.9 | 0.7 | 0.76 | n.s. | 9.3 ± 0.3 | 1.4 |
| Rectal pad | 7.0 ± 0.4 | 0.7 | 7.8 ± 0.4 | 0.4 | 0.90 | n.s. | ||
| Garland cells | 10 ± 1.9 | 1.6 | ||||||
| Whole body | 10 ± 1.1 | 18 ± 2.0 | 0.57 | p < 0.05 | 6.4 ± 0.3 | |||
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| Transcript | Male | Female | Larval | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Name | ID | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Ht | Ts | Ag | Cs | Rp | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Ht | Ov | Vs | Ms | Cs | Rp | Ns | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Tr | Cs | Ga |
| RA | FBtr0087529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RB | FBtr0087527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RC | FBtr0087528 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RD | FBtr0087526 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RF | FBtr0112795 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RI | FBtr0290034 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RJ | FBtr0290035 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RK | FBtr0339960 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RL | FBtr0339961 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RM | FBtr0339962 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RN | FBtr0346946 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
*Tissue Comparability:
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.