FlyAtlas 2 – Gene
For a particular Drosophila gene, find the pattern of expression in different tissues.
Gene Symbol (e.g. vkg) — start typing, then select from the autosuggest menu
Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Transcript ID (e.g. FBtr0079036)
Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Transcript ID (e.g. FBtr0079036)
Gene:
Symbol
SNF4Aγ
SNF4Aγ
Name
SNF4/AMP-activated protein kinase gamma subunit
SNF4/AMP-activated protein kinase gamma subunit
Annotation Symbol
CG17299
CG17299
Paralogues
No paralogues
No paralogues
| Adult Male | Adult Female | Male v. Female | Larval | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tissue | FPKM | Enrichment | FPKM | Enrichment | M/F | p value | FPKM | Enrichment |
| Head | 18 ± 1.5 | 0.8 | 18 ± 1.9 | 1.0 | 1.01 | n.s. | ||
| Eye | 23 ± 2.5 | 1.0 | 19 ± 0.4 | 1.1 | 1.25 | n.s. | ||
| Brain / CNS | 19 ± 0.2 | 0.8 | 17 ± 2.0 | 1.0 | 1.10 | n.s. | 7.9 ± 0.2 | 0.7 |
| Thoracicoabdominal ganglion | 25 ± 0.5 | 1.1 | 24 ± 0.8 | 1.4 | 1.03 | n.s. | ||
| Crop | 47 ± 1.7 | 2.1 | 32 ± 8.8 | 1.9 | 1.44 | n.s. | ||
| Midgut | 52 ± 3.6 | 2.3 | 23 ± 3.3 | 1.3 | 2.2 | p < 0.01 | 30 ± 0.9 | 2.6 |
| Hindgut | 49 ± 1.2 | 2.2 | 52 ± 4.5 | 3.0 | 0.94 | n.s. | 14 ± 4.4 | 1.2 |
| Malpighian Tubules | 33 ± 6.4 | 1.5 | 36 ± 2.1 | 2.1 | 0.93 | n.s. | 13 ± 1.2 | 1.2 |
| Rectal pad | 46 ± 4.0 | 2.0 | 28 ± 1.8 | 1.6 | 1.63 | n.s. | ||
| Salivary gland | 46 ± 0.1 | 2.0 | 32 ± 0.9 | 1.8 | 1.46 | n.s. | 9.2 ± 2.3 | 0.8 |
| Fat body | 28 ± 2.1 | 1.2 | 21 ± 0.5 | 1.2 | 1.32 | p < 0.05 | 12 ± 2.4 | 1.0 |
| Heart | 34 ± 6.5 | 1.5 | 25 ± 2.0 | 1.5 | 1.34 | n.s. | ||
| Trachea | 8.1 ± 0.3 | 0.7 | ||||||
| Ovary | 16 ± 0.3 | 0.9 | ||||||
| Virgin Spermatheca | 35 ± 3.9 | 2.0 | ||||||
| Mated Spermatheca | 38 ± 5.7 | 2.2 | ||||||
| Testis | 9.0 ± 1.7 | 0.4 | ||||||
| Accessory glands | 19 ± 0.3 | 0.8 | ||||||
| Carcass | 25 ± 0.1 | 1.1 | 27 ± 3.4 | 1.5 | 0.95 | n.s. | 8.6 ± 0.1 | 0.7 |
| Garland cells | 23 ± 2.7 | 2.0 | ||||||
| Whole body | 23 ± 0.7 | 18 ± 1.0 | 1.30 | p < 0.01 | 12 ± 1.0 | |||
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| Transcript | Male | Female | Larval | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Name | ID | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Rp | Sg | Fb | Ht | Ts | Ag | Cs | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Rp | Sg | Fb | Ht | Ov | Vs | Ms | Cs | Ns | Mg | Hg | Tu | Sg | Fb | Tr | Cs | Ga |
| RA | FBtr0084018 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RB | FBtr0084019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RC | FBtr0084021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RE | FBtr0084022 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RF | FBtr0084020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RG | FBtr0084024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RI | FBtr0110937 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RJ | FBtr0110938 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RK | FBtr0110939 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RM | FBtr0112915 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RN | FBtr0112916 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RO | FBtr0301585 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RP | FBtr0301586 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RQ | FBtr0301587 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RR | FBtr0301588 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RS | FBtr0301589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
*Tissue Comparability:
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.