FlyAtlas 2 – Gene
For a particular Drosophila gene, find the pattern of expression in different tissues.
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Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Gene:
| Adult Male | Adult Female | Male v. Female | Larval | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tissue | FPKM | Enrichment | FPKM | Enrichment | M/F | p value | FPKM | Enrichment |
| Head | 40 ± 2.5 | 2.2 | 30 ± 2.2 | 2.9 | 1.32 | p < 0.01 | ||
| Eye | 50 ± 9.9 | 2.8 | 31 ± 2.8 | 3.0 | 1.60 | n.s. | ||
| Brain / CNS | 58 ± 1.8 | 3.2 | 51 ± 11 | 5.0 | 1.13 | n.s. | 22 ± 2.5 | 5.4 |
| Thoracicoabdominal ganglion | 67 ± 6.3 | 3.7 | 64 ± 7.9 | 6.2 | 1.04 | n.s. | ||
| Crop | 14 ± 1.8 | 0.8 | 13 ± 0.3 | 1.2 | 1.10 | n.s. | ||
| Midgut | 12 ± 0.7 | 0.7 | 5.9 ± 0.8 | 0.6 | 2.0 | p < 0.01 | 4.4 ± 1.0 | 1.1 |
| Hindgut | 12 ± 1.0 | 0.6 | 12 ± 2.5 | 1.1 | 0.98 | n.s. | 7.3 ± 0.8 | 1.8 |
| Malpighian Tubules | 13 ± 0.4 | 0.7 | 14 ± 1.1 | 1.4 | 0.95 | n.s. | 8.8 ± 1.1 | 2.2 |
| Fat body | 3.0 ± 0.2 | 0.2 | 3.7 ± 0.9 | 0.4 | 0.82 | n.s. | 0.9 ± 0.5 | 0.2 |
| Salivary gland | 17 ± 1.7 | 0.9 | 15 ± 3.1 | 1.5 | 1.13 | n.s. | 5.2 ± 0.8 | 1.3 |
| Heart | 6.2 ± 3.4 | 0.3 | 6.5 ± 2.5 | 0.6 | 0.96 | n.s. | ||
| Trachea | 12 ± 0.2 | 2.9 | ||||||
| Ovary | 11 ± 0.6 | 1.1 | ||||||
| Virgin Spermatheca | 12 ± 1.7 | 1.1 | ||||||
| Mated Spermatheca | 13 ± 2.2 | 1.2 | ||||||
| Testis | 5.3 ± 0.6 | 0.3 | ||||||
| Accessory glands | 19 ± 2.8 | 1.0 | ||||||
| Carcass | 14 ± 3.9 | 0.8 | 10 ± 2.6 | 1.0 | 1.42 | n.s. | 8.5 ± 1.2 | 2.1 |
| Rectal pad | 8.5 ± 0.5 | 0.5 | 10.0 ± 1.4 | 1.0 | 0.85 | n.s. | ||
| Garland cells | 13 ± 2.4 | 3.1 | ||||||
| Whole body | 18 ± 1.0 | 10 ± 0.5 | 1.75 | p < 0.01 | 4.0 ± 0.9 | |||
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| Transcript | Male | Female | Larval | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Name | ID | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Ht | Ts | Ag | Cs | Rp | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Ht | Ov | Vs | Ms | Cs | Rp | Ns | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Tr | Cs | Ga |
| RA | FBtr0070299 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RB | FBtr0070300 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RC | FBtr0100557 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RD | FBtr0305497 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RE | FBtr0305498 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RF | FBtr0305499 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RH | FBtr0307895 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RI | FBtr0309961 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RJ | FBtr0309962 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RK | FBtr0309963 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RM | FBtr0309965 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RN | FBtr0339272 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RO | FBtr0339273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RP | FBtr0339274 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
*Tissue Comparability:
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.