FlyAtlas 2 – Gene
For a particular Drosophila gene, find the pattern of expression in different tissues.
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Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Gene:
| Adult Male | Adult Female | Male v. Female | Larval | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tissue | FPKM | Enrichment | FPKM | Enrichment | M/F | p value | FPKM | Enrichment |
| Head | 152 ± 9.6 | 0.1 | 266 ± 28 | 0.6 | 0.57 | p < 0.05 | ||
| Eye | 64 ± 33 | 0.1 | 78 ± 0.9 | 0.2 | 0.82 | n.s. | ||
| Brain / CNS | 41 ± 62 | 0.0 | 17 ± 9.3 | 0.0 | 2.5 | n.s. | 5.2 ± 3.2 | 0.0 |
| Thoracicoabdominal ganglion | 556 ± 153 | 0.5 | 383 ± 75 | 0.9 | 1.45 | n.s. | ||
| Crop | 2201 ± 383 | 1.8 | 1979 ± 140 | 4.8 | 1.11 | n.s. | ||
| Midgut | 107 ± 7.5 | 0.1 | 62 ± 13 | 0.2 | 1.73 | p < 0.05 | 30 ± 6.1 | 0.2 |
| Hindgut | 212 ± 7.2 | 0.2 | 149 ± 13 | 0.4 | 1.42 | p < 0.01 | 305 ± 67 | 1.7 |
| Malpighian Tubules | 12 ± 1.1 | 0.0 | 13 ± 2.5 | 0.0 | 0.88 | n.s. | 4.3 ± 1.9 | 0.0 |
| Fat body | 59 ± 13 | 0.0 | 62 ± 6.4 | 0.2 | 0.95 | n.s. | 27 ± 27 | 0.2 |
| Salivary gland | 830 ± 252 | 0.7 | 190 ± 22 | 0.5 | 4.4 | n.s. | 1.8 ± 0.9 | 0.0 |
| Heart | 309 ± 62 | 0.3 | 251 ± 182 | 0.6 | 1.23 | n.s. | ||
| Trachea | 54 ± 30 | 0.3 | ||||||
| Ovary | 9.1 ± 1.6 | 0.0 | ||||||
| Virgin Spermatheca | 92 ± 29 | 0.2 | ||||||
| Mated Spermatheca | 96 ± 11 | 0.2 | ||||||
| Testis | 34 ± 11 | 0.0 | ||||||
| Accessory glands | 65 ± 6.4 | 0.1 | ||||||
| Carcass | 3995 ± 842 | 3.3 | 2643 ± 1005 | 6.4 | 1.51 | n.s. | 2127 ± 212 | 12 |
| Rectal pad | 552 ± 16 | 0.4 | 792 ± 64 | 1.9 | 0.70 | n.s. | ||
| Garland cells | 129 ± 103 | 0.7 | ||||||
| Whole body | 1229 ± 34 | 411 ± 52 | 3.0 | p < 0.01 | 177 ± 18 | |||
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| Transcript | Male | Female | Larval | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Name | ID | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Ht | Ts | Ag | Cs | Rp | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Ht | Ov | Vs | Ms | Cs | Rp | Ns | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Tr | Cs | Ga |
| RA | FBtr0083030 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RB | FBtr0083031 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RC | FBtr0083032 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RD | FBtr0083033 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RE | FBtr0083034 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RF | FBtr0302142 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RG | FBtr0302143 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RH | FBtr0302144 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RI | FBtr0302145 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RJ | FBtr0302146 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RK | FBtr0306642 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RL | FBtr0306643 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RM | FBtr0306644 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RN | FBtr0334927 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RO | FBtr0334928 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RP | FBtr0345219 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RQ | FBtr0345220 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
*Tissue Comparability:
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.