FlyAtlas 2 – Gene
For a particular Drosophila gene, find the pattern of expression in different tissues.
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Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Gene:
| Adult Male | Adult Female | Male v. Female | Larval | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tissue | FPKM | Enrichment | FPKM | Enrichment | M/F | p value | FPKM | Enrichment |
| Head | 15 ± 0.4 | 1.0 | 18 ± 3.5 | 2.2 | 0.83 | n.s. | ||
| Eye | 16 ± 0.4 | 1.0 | 14 ± 0.2 | 1.7 | 1.11 | n.s. | ||
| Brain / CNS | 24 ± 1.3 | 1.5 | 23 ± 2.0 | 2.8 | 1.02 | n.s. | 11 ± 0.8 | 2.8 |
| Thoracicoabdominal ganglion | 37 ± 0.9 | 2.4 | 35 ± 2.7 | 4.3 | 1.06 | n.s. | ||
| Crop | 11 ± 4.2 | 0.7 | 6.0 ± 0.5 | 0.7 | 1.87 | n.s. | ||
| Midgut | 4.6 ± 0.4 | 0.3 | 3.2 ± 0.5 | 0.4 | 1.41 | p < 0.05 | 3.5 ± 0.6 | 0.9 |
| Hindgut | 4.8 ± 1.0 | 0.3 | 3.3 ± 0.2 | 0.4 | 1.43 | n.s. | 2.4 ± 0.4 | 0.6 |
| Malpighian Tubules | 2.1 ± 0.3 | 0.1 | 2.2 ± 0.1 | 0.3 | 0.96 | n.s. | 1.3 ± 0.3 | 0.3 |
| Fat body | 14 ± 0.8 | 0.9 | 15 ± 0.9 | 1.8 | 0.92 | n.s. | 10 ± 1.7 | 2.6 |
| Salivary gland | 22 ± 2.9 | 1.4 | 12 ± 0.4 | 1.4 | 1.85 | n.s. | 3.5 ± 0.2 | 0.9 |
| Heart | 13 ± 4.7 | 0.8 | 13 ± 6.2 | 1.6 | 0.97 | n.s. | ||
| Trachea | 5.5 ± 1.2 | 1.5 | ||||||
| Ovary | 4.9 ± 0.2 | 0.6 | ||||||
| Virgin Spermatheca | 56 ± 16 | 6.8 | ||||||
| Mated Spermatheca | 38 ± 3.6 | 4.6 | ||||||
| Testis | 6.0 ± 1.0 | 0.4 | ||||||
| Accessory glands | 6.8 ± 0.5 | 0.4 | ||||||
| Carcass | 19 ± 1.1 | 1.2 | 23 ± 3.7 | 2.8 | 0.83 | n.s. | 4.6 ± 0.5 | 1.2 |
| Rectal pad | 7.7 ± 0.7 | 0.5 | 8.2 ± 0.4 | 1.0 | 0.94 | n.s. | ||
| Garland cells | 34 ± 12 | 9.0 | ||||||
| Whole body | 16 ± 0.7 | 8.3 ± 0.7 | 1.89 | p < 0.01 | 3.8 ± 0.6 | |||
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| Transcript | Male | Female | Larval | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Name | ID | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Ht | Ts | Ag | Cs | Rp | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Ht | Ov | Vs | Ms | Cs | Rp | Ns | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Tr | Cs | Ga |
| RC | FBtr0099993 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RD | FBtr0305977 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RF | FBtr0305979 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RG | FBtr0333939 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RH | FBtr0333940 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RJ | FBtr0333941 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RK | FBtr0333942 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RL | FBtr0333943 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RM | FBtr0333944 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RN | FBtr0333945 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RO | FBtr0333946 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RP | FBtr0333947 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
*Tissue Comparability:
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.