FlyAtlas 2 – Gene
For a particular Drosophila gene, find the pattern of expression in different tissues.
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Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Gene:
| Adult Male | Adult Female | Male v. Female | Larval | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tissue | FPKM | Enrichment | FPKM | Enrichment | M/F | p value | FPKM | Enrichment |
| Head | 19 ± 2.2 | 0.2 | 26 ± 8.8 | 1.1 | 0.71 | n.s. | ||
| Eye | 6.6 ± 1.8 | 0.1 | 4.6 ± 0.1 | 0.2 | 1.43 | n.s. | ||
| Brain / CNS | 0.6 ± 0.5 | 0.0 | 0.4 ± 0.1 | 0.0 | 1.00 | n.s. | 1.6 ± 0.7 | 0.2 |
| Thoracicoabdominal ganglion | 15 ± 3.7 | 0.2 | 14 ± 2.2 | 0.6 | 1.11 | n.s. | ||
| Crop | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | N.A. | ||
| Midgut | 14 ± 0.7 | 0.2 | 4.8 ± 1.9 | 0.2 | 2.8 | p < 0.01 | 1.5 ± 0.7 | 0.2 |
| Hindgut | 16 ± 0.8 | 0.2 | 10 ± 3.8 | 0.4 | 1.52 | n.s. | 14 ± 5.9 | 1.5 |
| Malpighian Tubules | 8.8 ± 3.9 | 0.1 | 11 ± 4.7 | 0.4 | 0.84 | n.s. | 11 ± 1.5 | 1.2 |
| Fat body | 5.7 ± 1.6 | 0.1 | 6.7 ± 2.0 | 0.3 | 0.86 | n.s. | 1.7 ± 0.5 | 0.2 |
| Salivary gland | 12 ± 3.9 | 0.1 | 4.2 ± 2.5 | 0.2 | 2.8 | n.s. | 5.8 ± 1.0 | 0.6 |
| Heart | 16 ± 3.8 | 0.2 | 20 ± 5.2 | 0.8 | 0.81 | n.s. | ||
| Trachea | 7.5 ± 3.9 | 0.8 | ||||||
| Ovary | 1.7 ± 0.3 | 0.1 | ||||||
| Virgin Spermatheca | 32 ± 11 | 1.3 | ||||||
| Mated Spermatheca | 36 ± 5.1 | 1.5 | ||||||
| Testis | 26 ± 13 | 0.3 | ||||||
| Accessory glands | 5.0 ± 1.6 | 0.1 | ||||||
| Carcass | 34 ± 13 | 0.4 | 35 ± 12 | 1.4 | 0.96 | n.s. | 53 ± 9.7 | 5.8 |
| Rectal pad | 30 ± 2.3 | 0.4 | 31 ± 1.1 | 1.3 | 0.95 | n.s. | ||
| Garland cells | 15 ± 4.9 | 1.7 | ||||||
| Whole body | 82 ± 4.3 | 24 ± 1.2 | 3.4 | p < 0.01 | 9.1 ± 0.9 | |||
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| Transcript | Male | Female | Larval | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Name | ID | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Ht | Ts | Ag | Cs | Rp | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Ht | Ov | Vs | Ms | Cs | Rp | Ns | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Tr | Cs | Ga |
| RA | FBtr0072848 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RD | FBtr0309042 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RP | FBtr0332674 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RQ | FBtr0332675 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RR | FBtr0332676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RS | FBtr0332677 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RT | FBtr0332678 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RU | FBtr0332679 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RV | FBtr0332680 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RW | FBtr0332681 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RX | FBtr0332682 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RY | FBtr0332683 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RZ | FBtr0332684 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
*Tissue Comparability:
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.
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