FlyAtlas 2 – Gene
For a particular Drosophila gene, find the pattern of expression in different tissues.
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Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Gene:
| Adult Male | Adult Female | Male v. Female | Larval | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tissue | FPKM | Enrichment | FPKM | Enrichment | M/F | p value | FPKM | Enrichment |
| Head | 61 ± 3.5 | 2.1 | 47 ± 4.2 | 2.1 | 1.30 | p < 0.05 | ||
| Eye | 67 ± 12 | 2.3 | 48 ± 2.1 | 2.1 | 1.40 | n.s. | ||
| Brain / CNS | 81 ± 4.6 | 2.8 | 73 ± 17 | 3.2 | 1.12 | n.s. | 46 ± 9.6 | 2.4 |
| Thoracicoabdominal ganglion | 29 ± 0.5 | 1.0 | 28 ± 0.6 | 1.3 | 1.01 | n.s. | ||
| Crop | 31 ± 3.5 | 1.1 | 16 ± 3.0 | 0.7 | 1.94 | n.s. | ||
| Midgut | 16 ± 1.0 | 0.5 | 10 ± 0.7 | 0.4 | 1.59 | p < 0.01 | 23 ± 3.0 | 1.2 |
| Hindgut | 13 ± 0.9 | 0.5 | 11 ± 1.5 | 0.5 | 1.18 | n.s. | 11 ± 1.5 | 0.6 |
| Malpighian Tubules | 8.7 ± 1.5 | 0.3 | 7.0 ± 1.2 | 0.3 | 1.24 | n.s. | 5.6 ± 1.9 | 0.3 |
| Fat body | 5.4 ± 1.1 | 0.2 | 7.9 ± 0.9 | 0.3 | 0.68 | p < 0.05 | 14 ± 14 | 0.8 |
| Salivary gland | 20 ± 4.1 | 0.7 | 15 ± 3.0 | 0.7 | 1.30 | n.s. | 11 ± 1.6 | 0.6 |
| Heart | 10 ± 4.0 | 0.3 | 9.6 ± 4.9 | 0.4 | 1.06 | n.s. | ||
| Trachea | 22 ± 6.6 | 1.2 | ||||||
| Ovary | 26 ± 1.5 | 1.1 | ||||||
| Virgin Spermatheca | 32 ± 5.0 | 1.4 | ||||||
| Mated Spermatheca | 28 ± 1.1 | 1.2 | ||||||
| Testis | 8.2 ± 1.2 | 0.3 | ||||||
| Accessory glands | 20 ± 2.0 | 0.7 | ||||||
| Carcass | 35 ± 0.9 | 1.2 | 32 ± 2.9 | 1.4 | 1.06 | n.s. | 15 ± 0.4 | 0.8 |
| Rectal pad | 37 ± 3.6 | 1.3 | 45 ± 3.3 | 2.0 | 0.82 | n.s. | ||
| Garland cells | 52 ± 11 | 2.7 | ||||||
| Whole body | 29 ± 0.3 | 22 ± 0.2 | 1.31 | p < 0.01 | 19 ± 5.2 | |||
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| Transcript | Male | Female | Larval | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Name | ID | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Ht | Ts | Ag | Cs | Rp | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Ht | Ov | Vs | Ms | Cs | Rp | Ns | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Tr | Cs | Ga |
| RA | FBtr0078468 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RC | FBtr0078470 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RD | FBtr0111017 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RE | FBtr0301364 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RF | FBtr0304980 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RG | FBtr0304981 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RH | FBtr0304982 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RI | FBtr0304983 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RK | FBtr0304984 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RL | FBtr0332736 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RM | FBtr0333222 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RN | FBtr0346820 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
*Tissue Comparability:
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.